Ibrahimovic fick det gula kortet efter en rörig situation i det spanska straffomrÄdet i den tredje tillÀggsminuten.
Tv-bilderna visade hur han med full kraft sÀtter vÀnster arm och armbÄge i ryggen pÄ Azpilicueta.
FÄ uppfattade att den tyske domaren Felix Brych gav den svenske anfallsstjÀrnan hans andra varning i kvalet.
Men ett gult kort registrerades pĂ„ flera fotbollssajter och resultatsajter samt pĂ„ Uefas hemsida â och TT:s bild bekrĂ€ftar att varningen delades ut.
ââJag sĂ„g inget gult kort, sade Albin Ekdal pĂ„ presskonferensen.
Ăven Krafth avstĂ€ngd
Presschefen Jakob Kakembo Andersson sade till flera svenska medier att han var rÀtt sÀker pÄ att Ibrahimovic hade fÄtt en varning i matchens absoluta slutskede.
Landslagschefen Stefan Pettersson bekrÀftade kort senare för Aftonbladet att sÄ verkligen var fallet.
Det innebÀr att landslaget fÄr klara sig utan bÄde Ibrahimovic och Emil Krafth, Àven han fick sin andra varning, i den första playoff-matchen i mars.
Sverige mÄste vinna den för att nÄ finalmatchen om en plats i VM-slutspelet.
Ălvaro Morata slĂ€ckte det svenska hoppet om ett direktavancemang till VM i Qatar 2022 nĂ€r han tryckte in 1â0 till Spanien i den 86:e minuten.
Morata om Ibrahimovics överfall pÄ Azpilicueta:
ââJag vet inte, Ibra Ă€r en av de starkaste i vĂ€rlden. Ibland kan det hĂ€nda med ben och armar. Det Ă€r fotboll, en kontaktsport. Jag vet att han Ă€r en bra man. Jag tog en bild med honom och mina barn en gĂ„ng. Han behandlade mig bra.
"Vi gör en bra match"
Zlatan Ibrahimovic var annars nöjd med lagets insats.
ââVi gör en bra match och har bra chanser. BĂ€ttre chanser Ă€n de. Det Ă€r synd att vi förlorar, sade han till C More.
ââSĂ„ Ă€r det med fotboll. Framför allt nĂ€r man möter sĂ„dana hĂ€r nationer, en chans Ă€r ett mĂ„l. Det Ă€r okej, vi lĂ€r oss av det.
Ibrahimovic har missat de senaste landslagssamlingarna till följd av en hÀlseneskada, och comebacken resulterade i tvÄ tunga kvalförluster.
Han tyckte ÀndÄ att det varit positiva veckor.
ââDet Ă€r bara matcherna som varit negativt, det Ă€r synd. Men sjĂ€lv kĂ€nns det bra, vĂ€ldigt bra, sade Ibrahimovic.
Nu vÀntar en lÄng paus frÄn landslaget innan playoffet avgörs i mars. Riktigt sÄ lÄngt fram kan MilanstjÀrnan inte blicka just nu.
ââVi fĂ„r vĂ€l se vem vi fĂ„r i playoff, men det Ă€r lĂ„ngt fram. Jag vet inte ens om jag lever vid playoff, sade han.
Lever gör han förhoppningsvis, men spelar gör han inte, i alla fall inte i semifinalen mot Ànnu okÀnt motstÄnd.
Förbundskapten Janne Andersson hoppas att den 40-Ärige anfallaren finns med nÀr det Àr dags för en eventuell final i playoff.
ââĂr han hel och frisk kan han tillföra mycket i det hĂ€r laget. Jag har jĂ€ttegĂ€rna med Zlatan. Jag hoppas att han lever.