Spanska åklagare lägger även ned utredningen mot övriga tidigare misstänkta, bland annat Neymars föräldrar.
Neymar, i dag i Paris Saint-Germain, var anklagad för bedrägeri och korruption gällande hans övergång till Barcelona från Santos 2013.
30-åringen har sagt att han inte kommer ihåg om han deltog i förhandlingarna som ledde till att avtalet slöts 2011. Övergången verkställdes två år senare.
Spanska åklagare begärde initialt två års fängelse för Neymar som påföljd samt 10 miljoner euro i böter. I Spanien omvandlas fängelsestraff under två år till villkorlig dom om förövaren inte tidigare är straffad och det inte handlar om våldsbrott.