Målet, som kom i den 18:e matchminuten, betydde 1–0 i en match som Sydafrika kom att vinna med 3–0 efter två mål i den andra halvleken.
Närmast för Sydafrika väntar svårspelade Nigeria, med elva segrar i Afrikanska mästerskapen genom historien, under tisdagen.
Detta var Magaias första landskamp sedan övergången till Morön BK från TUT Pretoria och nu står Magaia noterad för 13 landskamper. På dessa matcher har det blivit totalt åtta mål för den vindsnabba forwarden.
Under säsongen i Morön har 26-åringen gjort elva mål på 16 matcher, varav 14 matcher från start.