Men Khamenei står bakom det icke-folkvalda Väktarrådets beslut att stoppa flera tunga, moderata, konservativa politiker från att ställa upp, rapporterar statlig tv.
Bland de sju kandidater som godkänts märks den ultrakonservative Ebrahim Raisi, som är chef för landets rättsväsende. Han spås nu ha goda chanser att vinna då flera av hans viktigaste rivaler diskvalificerats, däribland Rohanis allierade Ali Larijani, tidigare talman i parlamentet.
Valdeltagandet väntas bli lågt enligt flera opinionsundersökningar. Oppositionsaktivister har uppmanat till valbojkott i protest mot det auktoritära styret.
Ayatolla Ali Khamenei uppmanar folk att "inte lyssna på de som hävdar att det är meningslöst att gå till valurnorna".