Det kan röra sig om miljonbelopp som varje år slussas till terrorister, i och utanför landet, enligt Cecilia Ekenbäck, enhetschef på Finansinspektionen (FI).
I en rapport från 16 svenska myndigheter efterlyses åtgärder.
Att det är relativt begränsade belopp som förs över från Sverige till terroristorganisationer innebär inte att hotet är försumbart, enligt Ekenbäck.
- Även små penningströmmar kan leda till svåra konsekvenser genom de allvarliga våldsbrott som de faktiskt bidrar till, säger hon.